熊本県内で激甚災害が発生した場合には、財団では国や県の支援を受けて、中小企業・小規模事業者の支援を行います。特に熊本地震の際には、被災中小企業施設・設備整備支援事業などにより、地元経済の復興支援に向けた活動を行っています。